O princípio é o mesmo: dentro do cilindro, entra ar e combustível. Uma faísca queima o produto e o ar que estiver misturado ali explode, movimentando o pistão. Para que isso aconteça com gasolina, tem que haver uma parte dela para 14 de ar. Já com o álcool, é uma parte para apenas nove.

Enquanto em motores Ciclo Otto a combustão ocorre por meio de uma faísca, que é produzida pela vela de ignição ou sistema de ignição eletrônica, os motores a diesel fazem essa queima de combustível a partir do calor liberado quando o ar é altamente comprimido na câmara de combustão.

O motor flex possui revestimentos próprios para resistir as corrosões causadas pelos dois combustíveis – álcool e gasolina – e funciona da mesma forma que os motores que utilizam apenas um tipo de combustível, também conhecidos como monocombustíveis.